一些乙肝患者在服用核苷(酸)类药物治疗后一般都要定期复查乙肝五项、HBV DNA和肝功能。现在大多数医院都能进行乙肝表面抗原的定量检测，一些患者看到自己检测结果中乙肝表面抗原(HBsAg)经常有波动，就特别担心病毒耐药，甚至有一些医生也把这一指标误认为是病毒耐药的指标，来回给病人改变治疗方案。
乙型肝炎病毒复制离不开一种酶的作用，这种酶被称为：DNA聚合酶(HBV DNA-p)。核苷(酸)类药物的作用机制中假扮成HBV DNA复制时所需要的核苷酸，导致乙肝病毒复制中止。药物作用的部位也就是发生耐药的位点，这一部位常常受到药物的攻击，发生了耐药。耐药后，乙肝病毒复制失去了抑制，HBV DNA水平就会升高。所以，病毒耐药的部位发生在DNA聚合酶的部位，耐药的表现是HBV DNA升高。而乙肝表面抗原不是药物攻击的部位，所以，它的升高与降低与乙肝病毒对核苷(酸)类药物的耐药无关。
乙肝病毒表面抗原的高低与乙肝病毒cccDNA有一定的相关性，虽然它的高低与病毒耐药无关。但乙肝表面抗原的波动却能够表明不能随便停药，乙肝病毒复制的模板cccDNA在体内还有很多，停药后很可能反弹。
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