急性乙型肝炎病人一般是在e抗原消失后才出现乙肝e抗体阳性，这是好兆头，表示由急性期向恢复期过渡，但如果出现在慢性肝炎病人，e抗原阴性，乙肝e抗体阳性并不一定是好兆头，此时必须检查HBV-DNA，如果其阴性，转氨酶又正常，可以说是好事，因为它预示着病情处于稳定阶段，在医学上称为慢性乙型肝炎无复制或低复制期，患者经过和疾病的自身斗争，病情好转。
但如果此时的HBV-DNA是阳性的，那就不是好事，很大可能是乙型肝炎病毒DNA的C区和前C区发生了变异，病毒仍在活跃复制，这样的患者，一般病程较长，很多都是已经进入肝硬化的患者。所以对乙肝e抗体阳性和转氨酶及DNA状况等综合在一起进行判断。
HBeAg和乙肝e抗体阳性作为重要的乙肝病毒血清标志物，二者一般总是“你来我往”，HBeAg阳性慢性HBV感染者如果发生HBeAg血清学应答后大部分会产生抗HBe（即HBeAg血清学转换），在发生HBeAg血清学转换过程中少数患者会出现HBeAg和抗HBe共存。这样一种过渡状态对于临床检验工作而言该如何应对呢？显然不是HBeAg和抗HBe检测结果呈双阳性就可以解释为二者共存。
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