对乙肝疫苗反应不佳的人通常是因为以下因素：超过40岁、肥胖、抽烟或酗酒，尤其是有严重肝病患者。 免疫抑制的病人或接受肾脏透析的病人也可能对乙肝疫苗反应较差或需要更大剂量、频率的乙肝疫苗注射。至少已有一个研究指出，乙型肝炎的乙肝疫苗在HIV患者体内较难生效。
目前认为乙肝疫苗只能提供五到七年的免疫保护，但随后发现人体免疫记忆功能会发展出长期免疫。长期免疫会长久维持而不受体内抗体减少的影响，因此在乙肝疫苗成功建立对乙型肝炎病毒免疫功能的个体中，终生不需要再做抗体数值追踪及补打乙肝疫苗。
在长期实验中，那些施打乙肝疫苗一开始即有适当抗体数量的个体，乙肝疫苗保护力至少维持25年。英国的指导方针建议对于需要持续保护力的人群，例如医药卫生工作者，至少每五年施打一剂乙肝疫苗。
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