慢性丙肝(CHC)是由丙型肝炎病毒引起的全身性疾病，如果不进行及时治疗，会给身体的其他组织带来伤害。一般丙肝病毒主要感染肝脏。除了肝脏外，丙型肝炎病毒还可以累及许多其他组织和器官，如淋巴结、肾脏、骨髓和甲状腺。研究表明，约74%的慢性丙型肝炎病毒感染患者会出现肝外表现。一方面，临床医生应努力消除丙型肝炎病毒，缓解肝外疾病。另一方面，应谨慎选择抗病毒药物，避免加重肝外疾病(特别是自身免疫性疾病)，防止潜在不良反应发生。
丙型肝炎病毒感染和糖尿病。研究表明，丙型肝炎病毒感染患者的糖尿病患病率高于普通人群。丙型肝炎病毒感染是糖尿病的危险因素，糖尿病的存在又与肝损伤的严重程度有关。值得注意的是，2型糖尿病患者感染丙型肝炎病毒后，疾病进展可能更迅速，更有可能恶化为肝纤维化、肝硬化甚至肝细胞癌(HCC)，预后较差。丙型肝炎病毒感染和肾脏疾病。丙型肝炎病毒感染可引起肾脏相关疾病，包括膜性增生性肾小球肾炎和混合型冷球蛋白血症，导致慢性肾脏疾病(CKD)。丙型肝炎病毒感染后约36%的患者出现CKD，35%的CKD患者出现快速疾病进展。CHC患者CKD的风险因素包括年龄、女性、伴发糖尿病、高血压、肝硬化和静脉注射吸毒者。
丙型肝炎病毒感染和其他疾病。除了糖尿病和肾脏疾病之外，丙肝病毒感染还可能引起甲状腺疾病和血液病。近年来，继发于丙型肝炎病毒感染所致心血管疾病的动脉粥样硬化发病和死亡风险增加，使其越来越受到重视。
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