腹泻，包括严重腹泻，是阿法替尼（Afatinib）最常见的不良反应之一。腹泻可以导致伴有或不伴有肾功能损害的脱水，在极少数病例中可导致致命结果。腹泻通常发生在治疗的前2周。3级腹泻最常发生于治疗的前6周。LUX-Lung 3临床中，阿法替尼组与培美曲塞/顺铂组相比，腹泻的发生率更高（95% VS 15%）。
LUX-Lung 6临床中，阿法替尼组与吉西他滨/顺铂组相比，腹泻的发生率更高（90% VS 15%）。LUX-Lung 8临床中，阿法替尼组与厄洛替尼组相比，腹泻的发生率更高（70% VS 33%）。腹泻的主动管理很重要，包括充足的补液和及时使用抗腹泻剂（如洛哌丁胺）。首次出现腹泻症状时，就应该及时治疗，持续治疗至腹泻停止12小时。
严重腹泻的患者（持续48小时的2级腹泻或出现了3级腹泻）降低阿法替尼（Afatinib）的服用剂量或中断治疗。脱水的患者需要静脉给予电解质和补液。除了腹泻，阿法替尼的其它副作用还有皮疹、间质性肺炎、角膜炎等。
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