口服核苷（酸）类似物的广泛应用使慢性乙型肝炎治疗取得了重大突破。越来越多的慢性乙肝患者接受了以口服核甘(酸)类药物为主的抗病毒治疗，很多患者因此而受益，如目前临床因失代偿性肝硬化和肝癌需要住院治疗的患者数量较以往明显减少。恩替卡韦分散片和替诺福韦都具备很强的抗病毒活性、很低的耐药性和较好的安全性。目前有证据显示，对于治疗前HBV DNA水平很高的患者，给予替诺福韦抗病毒治疗患者出现病毒学应答不佳的概率很低。
此外，替诺福韦自批准上市以来，一直以“零”耐药数据广泛宣传，是慢性乙型肝炎抗病毒治疗的的首选理想药物。而且，2015年版《慢性乙型肝炎防治指南》中可以看出：服用恩替卡韦或阿德福韦治疗期间意外怀孕的，换用替诺福韦或替比夫定后仍然可以继续怀孕。不过，要值得注意的是，替诺福韦在长期治疗过程中，小部分患者可能发生以肾小管损伤为特征的肾功能损害。因此，对于服用替诺福韦进行长期抗病毒治疗的慢性乙肝患者，临床医生除了常规监测肝功能、HBV DNA、甲胎蛋白和上腹部彩超外，肾功能、血钙血磷和尿常规的监测亦不容忽视。
临床上对于年龄较大（一般年龄超过65周岁）、合并肾脏基础疾病或肾损伤发生高危人群、骨质疏松患者或高危人群、以及曾经发生过脆性骨折的慢性乙肝患者，应在充分权衡利弊后，慎重选择替诺福韦进行长期抗病毒治疗，或者选用恩替卡韦长期抗病毒治疗。著名的REALM研究（俗称080研究）结果提示，恩替卡韦在长达10年的治疗中并不增加非肝脏肿瘤的发生，也不增加神经肌肉和骨骼等药物相关严重不良事件的风险，其安全性优于其他抗病毒药物。因此，相对于替诺福韦和阿德福韦酯，恩替卡韦则是肾脏及骨骼安全性更高的一线抗病毒药物。
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