格列卫（伊马替尼）不仅是间质瘤患者的希望，可以有效降低患者术后复发风险，还是慢粒白血病的主要治疗药物。无数从格列卫（伊马替尼）中获益的患者，也都很无奈，为什么格列卫（伊马替尼）会耐药呢？格列卫对不同的突变位点效果也是不一样的。格列卫（伊马替尼)的耐药分为原发性耐药和继发性耐药两种。
原发耐药是指肿瘤为野生型KIT的胃肠道间质瘤。临床研究证实，外显子l1突变的GIST亚型对甲磺酸伊马替尼的治疗效果最好，有效率达83.5%;次为外显子9突变的亚型，有效率为47.8%，外显子13和外显子17突变的GIST亚型临床上少见。这两类亚型在体外实验中对格列卫敏感，临床疗效有待观察。临床研究发现并非所有野生型KIT的GIST对格列卫均耐药。其中部分仍有良好疗效。
实验证实第12外显子突变的亚型在体外对格列卫敏感，在临床研究中也显示格列卫（伊马替尼）对此亚型具有一定疗效;第18外显子突变亚型中存在D842V突变株对格列卫耐药，存在其他突变株对该药敏感。与原发耐药相比，格列卫继发耐药的机制并不十分清楚，可能的机制包括KIT或PDGFRA基因的扩增、其他致癌通路的激活或c-kit基因或PDGFRA基因中与药物结合位点的获得性、继发性突变。
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