雷利度胺治疗缓解后5q-综合征的复发与其体内残存的耐药恶性克隆干细胞增殖相关，Tehranchi等对7例5q-综合征病人应用雷利度胺治疗期间恶性克隆的变化进行检测。他们发现治疗前5q-综合征病人骨髓中无论是CD34+CD38-CD90+的造血干细胞还是CD34+CD38+的造血祖细胞，绝大多数为5q-恶性克隆。
雷利度胺主要作用于CD34+CD38+的5q-造血祖细胞，而CD34+CD38-/lowCD90+的5q-恶性克隆造血干细胞大部分处于静止期，雷利度胺不能有效地根除这部分恶性克隆造血干细胞。而这部分细胞是5q-综合征病人最终复发的根源。
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