以ALK基因突变的细胞为靶点的药物，大约5％的NSCLC在ALK基因中发生重排。这种改变最常见于不吸烟或轻度吸烟的腺癌（NSCLC的一种亚型）患者。ALK基因重排产生异常的ALK蛋白，导致癌细胞生长和扩散。
以异常ALK蛋白为靶点的药物包括：克唑替尼、色瑞替尼、艾乐替尼、Brigatinib、Lorlatinib。在具有ALK基因改变的肺癌患者中，这些药物常常可以使肿瘤缩小。虽然它们可以在化疗不再起效后再使用并带来疗效，但在有ALK基因重排的肺癌患者中，它们也经常代替化疗。
这些药物中的至少一部分也可用于治疗具有ROS1基因改变的癌症患者。这些药物是口服的药片。ALK抑制剂的常见副作用包括：恶心和呕吐、腹泻、便秘、疲倦、视力改变。其中一些药物也可能产生其他副作用。一些副作用可能比较严重，例如白细胞计数降低、肺部或身体其他部位的炎症（肿胀）、肝损伤、神经损伤（周围神经病变），以及心律问题。
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