肝活检被认为是建立肝脏炎症程度和肝组织可能瘢痕形成（纤维化程度）的非常有用的方法。在活组织检查中，在局部麻醉下直接从肝脏去除组织，并使用显微镜检查。对于大多数患有丙型肝炎的人，可以在组织中检测到慢性炎症征兆。这是一种侵入性（因此是组织损伤）的方法，并不是完全无风险，对许多人而言也是痛苦的。并发症，如出血，可能发生在少数人正在接受这一程序。
做肝活检有三种不同的方法：经皮，腹腔镜和经静脉；
对于经皮肝活组织检查，给予局麻药麻醉该区域，并且通过切口将针插入右侧以取回组织样品。可以使用超声图像来引导插入。在手术过程中和手术后可能会有压力和沉痛的感觉。
腹腔镜活检包括放置一个管（腹腔镜）通过腹部切口。腹腔镜将图像发送到医生使用的监视器，以指导组织样本的移除。
通过将导管（管）插入颈部的静脉并将其引导到肝脏来进行经静脉活检。然后针头进入导管以从肝脏去除组织样品。当患者可能有血液凝固问题或腹部液体时，通常使用这种技术。
在手术前8至10小时通常需要禁食。肝活检被认为是小手术，所以通常在门诊就诊在医院。之后，患者需要休息一到两个小时才能回家。接下来的八到十二个小时应该在床上度过。在这段时间内，切口需要大约一周的时间才能避免肝脏的愈合和体力消耗。
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